test: add coverage for issue #91 runtime modules

[knqiufan]

关联 Issue

Closes #91

变更类型（勾选所有适用项）

• fix bug 修复
• test 仅测试

影响范围

• 仅涉及测试与一处内部的跨平台回退一致性修复

变更说明（why，而非 what）

Issue #91 指出的七个关键运行时模块此前没有进入覆盖率统计，导致全局覆盖率无法反映这些模块的实际测试情况。本 PR 将它们纳入覆盖率报告，并为 AgentTeam、Harness、ToolRuntime、原生文件与 Shell 工具、CodingBridge 及 ConversationMemory 的关键路径补充单元测试。

本次 CI 失败修复：Grep 在没有 rg 的环境会使用 JS 回退。该回退此前将 include: *.ts 仅匹配根目录文件，和 ripgrep 的任意目录深度文件名匹配行为不一致；现已修正并由新增用例覆盖。

测试计划

• 单元测试：pnpm test
• 覆盖率：pnpm test:coverage
• 手工验证：检查 GitHub Actions 失败日志，并在 Windows 本地复现 Shell 工具测试

自检清单

• 本地 pnpm check 已通过（lint / dep-guard / deadcode / tsc / format / test）
• 新加文件配套加入了 .test.ts
• 平台相关用例使用了 vi.skipIf，未硬编码平台判断
• 新增被覆盖统计的模块已同步加入 vitest.config.ts 的 coverage.include
• 不包含二进制、构建产物、密钥
• 未使用 --no-verify 绕过钩子