Sfp 101 nl

.zenodo.json

@@ -231,6 +231,37 @@
       "orcid": "0000-0003-2758-4723",
       "affiliation": "Instituut voor Natuur- en Bosonderzoek (INBO)",
       "corresponding": true
+    },
+    {
+      "name": {
+        "given": "Anouk",
+        "family": "Organe"
+      },
+      "type": "Researcher",
+      "email": "anouk.organe@inbo.be",
+      "orcid": "0009-0006-1202-1863",
+      "affiliation": "Instituut voor Natuur- en Bosonderzoek (INBO)",
+      "corresponding": true
+    },
+    {
+      "name": {
+        "given": "Frank",
+        "family": "Van De Meutter"
+      },
+      "type": "Researcher",
+      "email": "frank.vandemeutter@inbo.be",
+      "orcid": "0000-0002-9850-1860",
+      "affiliation": "Instituut voor Natuur- en Bosonderzoek (INBO)"
+    },
+    {
+      "name": {
+        "given": "Merlijn",
+        "family": "Jocqué"
+      },
+      "type": "Researcher",
+      "email": "merlijn.jocque@inbo.be",
+      "orcid": "0000-0002-7196-7476",
+      "affiliation": "Instituut voor Natuur- en Bosonderzoek (INBO)"
     }
   ]
 }

NEWS.md

@@ -1,3 +1,10 @@
+### First version of protocol: sfp-101-nl
+
+- Title: Veldstaalnameprotocol quickscan knijtenlarven
+- Published on: 2026-08-03
+- Version number: 2026.02
+- Link to this version: [sfp-101-nl version 2026.02](2026.02/index.html)
+
 ### First version of protocol: sop-040-nl
 
 - Title: Abundantie- en oppervlaktebepaling van groepsfoto’s met ongewervelden in ImageJ

source/sfp/1_water/sfp_101_nl_quickscan_knijten/.zenodo.json

@@ -0,0 +1,52 @@
+{
+  "description": "",
+  "title": "Veldstaalnameprotocol quickscan knijtenlarven.",
+  "upload_type": "publication",
+  "access_right": "open",
+  "license": "CC-BY 4.0",
+  "language": "nld",
+  "keywords": [
+    "knijten; Culicoides; veldstaalname; labo; estuaria; slikken"
+  ],
+  "publisher": "Instituut voor Natuur- en Bosonderzoek (INBO)",
+  "contributors": [
+    {
+      "name": "Organe, Anouk",
+      "affiliation": "Research Institute for Nature and Forest (INBO)",
+      "orcid": "0009-0006-1202-1863",
+      "type": "contactperson"
+    },
+    {
+      "name": "Van Hecke, Florian",
+      "affiliation": "Research Institute for Nature and Forest (INBO)",
+      "orcid": "0009-0004-3499-2279",
+      "type": "other"
+    },
+    {
+      "name": "Research Institute for Nature and Forest (INBO)",
+      "type": "rightsholder"
+    }
+  ],
+  "creators": [
+    {
+      "name": "Organe, Anouk",
+      "affiliation": "Research Institute for Nature and Forest (INBO)",
+      "orcid": "0009-0006-1202-1863"
+    },
+    {
+      "name": "Van De Meutter, Frank",
+      "affiliation": "Research Institute for Nature and Forest (INBO)",
+      "orcid": "0000-0002-9850-1860"
+    },
+    {
+      "name": "Jocqué, Merlijn",
+      "affiliation": "Research Institute for Nature and Forest (INBO)",
+      "orcid": "0000-0002-7196-7476"
+    }
+  ],
+  "communities": [
+    {
+      "identifier": "inbo"
+    }
+  ]
+}

source/sfp/1_water/sfp_101_nl_quickscan_knijten/01_afhankelijkheden.Rmd

@@ -0,0 +1,49 @@
+# Afhankelijkheden
+
+```{=html}
+<!--
+Hier niets invullen.
+Indien er afhankelijkheden zijn deze invullen in de yaml sectie van `index.Rmd`
+-->
+```
+```{r dependencies}
+empty_table <- tibble(
+  protocol_code = character(),
+  version_number = character(),
+  params = character(),
+  appendix = logical()
+) %>%
+  add_row() %>%
+  rename(
+    `Protocolcode` = protocol_code,
+    `Versienummer` = version_number,
+    `Opgenomen als subprotocol` = appendix
+  ) %>%
+  pander(split.tables = Inf)
+
+if (exists("params")) {
+  if (!is.null(params$dependencies)) {
+    transpose(params$dependencies) %>%
+      as_tibble() %>%
+      mutate(protocol_code = as.character(protocol_code),
+             version_number = as.character(version_number),
+             params = as.character(params),
+             version_number = ifelse(params == "NA",
+                                     paste0("[", version_number, "](../",
+                                            version_number, "/", "index.html)"),
+                                     version_number),
+             appendix = as.logical(appendix)) %>%
+      rename(
+        `Protocolcode` = protocol_code,
+        `Versienummer` = version_number,
+        `Opgenomen als subprotocol` = appendix
+      ) %>%
+      pander(split.tables = Inf)
+  } else {
+    empty_table
+  }
+} else {
+  empty_table
+}
+rm(empty_table)
+```

source/sfp/1_water/sfp_101_nl_quickscan_knijten/02_onderwerp.Rmd

@@ -0,0 +1,45 @@
+# Onderwerp
+
+## Definities en afkortingen
+
+```{=html}
+<!--
+Definities van begrippen en afkortingen die noodzakelijk zijn om dit document te begrijpen en het protocol op een gepaste manier te kunnen uitvoeren.
+-->
+```
+
+-   **Chla** = Chlorofyl-a
+
+-   **mTAW** = meter Tweede Algemene Waterpassing
+
+## Doelstelling en toepassingsgebied
+
+<!-- description: start -->
+
+<!-- description: end -->
+
+### Kadering
+
+Sinds de waterkwaliteit van de Zeeschelde na 2008 is verbeterd, worden op steeds meer plaatsen langs de Zeeschelde overlast door knijten (*Culicoides*, Ceratopogonidae) gemeld.
+Vermoedelijk gaat het in de meeste gevallen om *Culicoides riethi* Kieffer, 1914.
+De larven van deze soort komen voornamelijk voor in de hogere delen van intertidale zoetwaterslikken.
+De knijten komen soms in grote aantallen voor en kunnen heel wat hinder veroorzaken.
+Het toenemende aantal adviesvragen omtrent knijten, hun habitat, ecologie en bestrijding leidde tot een sterke toename van staalnames, waardoor de nood ontstond voor een gestandaardiseerde snelle en betrouwbare methode om de aanwezigheid van knijtenlarven vast te stellen.
+
+### Doelstelling
+
+Dit document beschrijft het INBO “QuickScan” protocol voor het bepalen van de densiteiten aan knijtenlarven (*Culidoides riethi*) in slikgebieden langs de Zeeschelde.
+Het protocol omvat de staalname in het veld en de procedure voor verwerking in het labo van biota.
+
+De QuickScan omvat enkel de bemonstering van biota in het veld en de snelle verwerking van de niet gepreserveerde stalen in het labo.
+Afhankelijk van de vraagstelling wordt dit best gecombineerd met sediment bemonsteringen die kijken naar granulometrie, gehalte organisch materiaal, watergehalte, bodemdichtheid, en concentratie chlorofyl-a.
+
+```{=html}
+<!--
+Doelstelling: omschrijving in woorden waarvoor het protocol dient.
+Voorbeelden wat er met de gegevens kan gedaan worden.
+Probeer de doelstelling zo veel mogelijk generiek te beschrijven en vermijd projectspecifieke doelstellingen.
+Toepassingsgebied: bespreek hier onder welke condities het protocol kan gebruikt worden.
+-->
+```
+

source/sfp/1_water/sfp_101_nl_quickscan_knijten/03_beperkingen.Rmd

@@ -0,0 +1,12 @@
+# Beperkingen van het protocol
+
+Nvt
+
+```{=html}
+<!--
+Alleen in te vullen indien van toepassing.
+Bespreek onder welke condities het protocol niet gebruikt kan worden of wanneer afwijkingen nodig zijn ten opzichte van het standaard protocol.
+Vermeld hier ook mogelijke interferenties, knelpunten, ...
+-->
+```
+

source/sfp/1_water/sfp_101_nl_quickscan_knijten/04_principe.Rmd

@@ -0,0 +1,12 @@
+# Principe
+
+```{=html}
+<!--
+Korte omschrijving van de principes waarop het protocol gebaseerd is.
+Bijvoorbeeld het principe achter het nemen van mengmonsters, principe achter visueel inschatten van de bedekking van een plant, ...
+-->
+```
+
+Dit protocol beschrijft de procedure voor het bepalen van de densiteiten aan knijtenlarven (*Culidoides riethi*) in slikgebieden langs de Zeeschelde.
+De voorgeschreven methode moet garanderen dat het geanalyseerde staal representatief is voor de actuele situatie op moment van de staalname in de slikken.
+Via dit veldprotocol zou elke medewerker in staat moeten zijn om de veldstaalname en laboverwerking van slibstalen voor knijtenonderzoek uit te voeren.

source/sfp/1_water/sfp_101_nl_quickscan_knijten/05_competenties.Rmd

@@ -0,0 +1,10 @@
+# Vereiste competenties
+
+```{=html}
+<!--
+Omschrijving van de basiskennis (bv. kennis van bepaalde soorten) en vaardigheden (bv. bepaalde apparatuur kunnen bedienen), die de gebruiker van het protocol moet hebben om het protocol op een gepaste manier te kunnen uitvoeren.
+Eventueel kan er verwezen worden naar bepaalde opleidingen.
+-->
+```
+
+Voldoende kennis van benthos om onderscheid te kunnen maken tussen knijtenlarven en andere organismen in de slibstalen tijdens het triëren in het labo.

source/sfp/1_water/sfp_101_nl_quickscan_knijten/06_benodigdheden.Rmd

@@ -0,0 +1,69 @@
+# Benodigdheden
+
+## Apparatuur
+
+- **Trimble gps** (eventueel punten vooraf inladen)
+
+```{=html}
+<!--
+Opsomming van de apparatuur die nodig is en verwijzingen naar de `sip`'s (Standaard Instrument Procedure; `<protocol-code>-YYYY.NN`) indien die er zijn.
+Indien geen specifiek `sip`'s voorhanden, illustreer de toegelaten apparatuur met foto's, geef het exacte type apparatuur mee, ...
+-->
+```
+
+## Materiaal
+
+### Veldstaalname
+
+- **Benthossteekbuis** van minimum 20 cm lang met een diameter van 4,5 cm + bijkomende stamper om het staal uit te duwen.
+
+- Gelabelde **potten** (0,5 L) of **zakjes**.
+  De labels worden bij voorkeur vooraf aangebracht met een watervaste stift.
+  Controleer steeds dat de stift water- en wrijfvast is.
+
+### **Optioneel bij het bemonsteren van sediment:**
+
+- kleine **steekbuis** van minimum 20 cm lang met een diameter van 2 cm
+
+- kleine **potjes** voor sediment en chlorofyl-a-stalen
+
+- **kopecky-ring**
+
+- **zakjes** of **potjes** voor bulk density stalen
+
+### Verwerking labo
+
+- **zeef** met maaswijdte **125 µm**
+
+- **zeef** met maaswijdte **212 µm**
+
+- **trieerbak met belichting**
+
+- **binoculaire microscoop**
+
+- **pincet**
+
+- **notitieboekje** en **potlood**/**pen**
+
+```{=html}
+<!--
+Opsomming van gebruikte materialen.
+Duidelijk aangeven welke materialen toelaatbaar zijn, welke volumes, afmetingen, materiaal, ... 
+Vermeld bijvoorbeeld niet staalnamepotje, maar wel: vierkant flesje, volume 250 ml, gegradueerd, vervaardigd uit `PE`, met afsluitbare deksel uit `PP`.
+-->
+```
+
+## Reagentia en oplossingen (indien van toepassing)
+
+```{=html}
+<!--
+Een opsomming van reagentia, welke zuiverheid, volume, veiligheidsvoorschriften.
+Bijvoorbeeld. Zwavelzuur (`H2SO4`), geconcentreerd (96%), pro analyse en veiligheidsinfo (sterk zuur, bijtend, gebruik handschoenen, bril en masker bij gebruik)
+Een opsomming van oplossingen, welke zuiverheid, volume, veiligheidsvoorschriften.
+Indien deze oplossingen zelf worden bereid, vermeld dan ook de bereidingswijze.
+bijvoorbeeld: Zwavelzuur `1M`: verdun zwavelzuur geconcentreerd 18 maal met `ultrapuur` water.
+Opgelet: giet altijd zwavelzuur bij water en nooit omgekeerd!
+-->
+```
+
+Nvt